As três secções da Missão Continente são Consciente, Comunidade e Sorriso. A primeira visa a construção de um futuro sustentável e trabalha áreas como a alimentação saudável, produção nacional, consumo consciente e sustentabilidade ambiental.
Por sua vez, a Missão Continente Comunidade aposta em projetos de coesão e bem-estar social, no âmbito do envelhecimento ativo, inclusão social, combate à fome, pobreza e desperdício alimentar, e ainda promoção do voluntariado.
Já a Missão Continente Sorriso tem como objetivo reforçar o apoio à saúde familiar, natalidade e promoção da saúde infantil em Portugal, através do apoio local em centros de saúde.
A Missão Continente conta com o apoio institucional do Ministério da Economia, Ministério do Ambiente, Ministério da Agricultura e do Mar, Ministério da Saúde, Ministério da Solidariedade, Emprego e Segurança Social, Associação Nacional de Freguesias Portuguesas e Associação Nacional de Municípios Portugueses.
