Ao longo da sua carreira, Filipe Caetano coordenou projetos nas mais variadas áreas da gestão: diagnósticos e análises estratégicas, estudos e diagnósticos de internacionalização, estudos de viabilidade, projetos de investimento e candidaturas a projetos financiados por Fundos Estruturais Comunitários.
O gestor foi sócio e acionista das empresas GTE Consultores, POGIC Consultores e Businet Plus, Consultadoria financeira e imobiliária. Foi administrador e CFO no Grupo SLN, em empresas do setor imobiliário e na holding do Grupo Espírito Santo.
Filipe Caetano passou também pela administração da COMETNA – Companhia Metalúrgica Nacional e trabalhou como liquidatário judicial pela Relação de Lisboa.